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葵ちゃんシミュレーター part2 前編
今回から、大きめのシミュレーターを書いていきますよ!!
(連休がほしい...)
【MD動画】超臨界水の構造
高温高圧条件での水の超臨界状態をシミュレートしたMD動画です。(温度400℃、密度0.3g/cm^3)
解説はブログ記事にて http://d.hatena.ne.jp/masa_cbl/20130224/1361706735
自作シミュレーション動画→mylist/8344044
BGMはニコニコモンズから使わせていただきました。
【MD動画】ヘリウム原子内包フラーレン(C60)、ドデカヘドラン(C20H20)
ヘリウム原子内包フラーレンとドデカヘドランのヘリウム原子の動きをMDシミュレーションで見てみました。
ヘリウム内包ドデカヘドランについては有機化学美術館(http://blog.livedoor.jp/route408/archives/52063943.html)を読んでみてください。
ブログ http://d.hatena.ne.jp/masa_cbl/
自作シミュレーション動画→mylist/8344044
BGMはニコニコモンズから使わせていただきました。
【分子動力学シミュレーション】水の蒸発
液体の水から水分子が蒸発して気体になる様子をシミュレーションしました。
ブログ http://d.hatena.ne.jp/masa_cbl/
自作シミュレーション動画→mylist/8344044。
BGMはニコニコモンズから使わせていただきました。
水の分子動力学シミュレーション【改訂版】
ひさびさに動画を作成したのでアップロード。今回はBGMをつけてみました(sm6691139を使わせていただきました)。エンコがなかなかキレイにできなくて試行錯誤中です。自作シミュレーション動画→mylist/8344044。
【分子動力学シミュレーション】クラウンエーテルのイオン取り込み
15員環のクラウンエーテルがナトリウムイオンを取り込む様子を計算した分子動力学シミュレーション(MDシミュレーション)の動画です。エンコード方法を改善したので、これまでの動画よりも見やすくなっていると思います。自作シミュレーション動画→mylist/8344044。ブログ(http://blog.goo.ne.jp/zero_app/)。
【分子動力学シミュレーション】水と油の分離シミュレーション
水と油が分離する様子を計算した分子動力学シミュレーション(MDシミュレーション)の動画です。周期境界条件を使っているので、箱の右から出た分子は左から、上から出たら下から入ってくるようになっています。 自作シミュレーション動画→mylist/8344044 詳細な計算条件などはブログ(http://blog.goo.ne.jp/zero_app/)に書いておきます。
水と氷の分子動力学シミュレーション
水と氷の分子動力学シミュレーション(MDシミュレーション)の動画です。1フレーム2フェムト秒、30fpsですので、1秒で60フェムト秒、30秒で1.8ピコ秒の時間になります。[追記]思ったより多くの人に見てもらえて光栄です。あと可視化はVMDを使ってます。 自作シミュレーション動画→mylist/8344044