1周目の最終セーブがレーザーマン戦前だったので、2周目ではレーザーマン戦後にセーブをしました。そうしないとセーブデータに撃破フラグが記録されず、3周目のウラインターネット5でレーザーマンV3が出現しません(検証済み)。
http://www.nicovideo.jp/watch/sm40140566