アズレンの「碧い砲撃」が全く気付かないうちにR-TYPEの「灯火」になる

敵性存在から得た技術を巡り、人類が対立し戦争を起こした世界。技術の元となった敵性存在は、本来は未来の人類の前に現れた敵を斃すための存在だった。しかしそれは巡り巡って現在時間軸の人類の敵となっている。ってストーリー。