ClustalWで解析した結果をTreeView Xで描写する
- 2010/01/28 16:29:52 投稿
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高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20100128.html#p01 ClustalWは複数のDNA配列やアミノ酸配列に対してマルチプルアライメントを行うツールです。EMBL-EBIの他にDDBJやKEGGでも同様のサービスが提供されています。また、TreeView Xはデンドログラムや系統樹などを描写するフリーソフトで、WindowsやUNIXでも利用できるマルチプラットフォームのソフトウェアです。今回使用するデータは「BLAST検索でヒットしたエントリ群のmulti fastaファイルを取得する 」で取得された上位20件の配列を使用し、ClustalWで解析されたデンドログラムの情報を使って系統樹を描写しています。今回はClustalwとTreeView Xを使用していますが、そのほかにも動画内で紹介しているJalViewでも同じようなことができます。