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ペイントソフトの塗りつぶし（バケツ）のように、指定した点から広がる領域のみを透過します。

ダウンロードリンク
https://www.axfc.net/u/3727336?key=aviutl
https://www.dropbox.com/s/4v4gphllfrvxt8e/nuritsubushi_chromakey.zip?dl=0
[2023/11/16追記]
代替推奨スクリプト　→ 塗潰しで透過スクリプト sm42068071

[2016/10/9追記]
似た機能を持つスクリプトが既にあるようです（塗りつぶし-色領域:ゆうきさん作）→sm16462679 削除済み
【それぞれの特徴】
塗りつぶし-色領域：圧倒的に軽い
塗りつぶしクロマキー：小領域除去機能
参考にしてください

http://www.nicovideo.jp/watch/sm29797191