Spotfireを用いたマイクロアレイデータのGene Ontologyによるアノテーション
- 2010/05/31 09:17:59 投稿
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高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090808.html#p01 今回の統合TVでは、データ可視化ツールであるSpotfire DecisionSiteを用いたマイクロアレイ解析の一事例を紹介します。概要としては、公共マイクロアレイデータベースから取得したマイクロアレイデータに対し、各プローブに GO Term を対応付け、異なる条件下で発現が変わる遺伝子群の生物学的な意味を考察できるよう可視化する、という流れです。今回例として用いたデータは、ヒトの脂肪細胞分化のマイクロアレイデータ(GSE1657)を一部改変したサンプルデータを用いています。