EMBOSS sixpackを使い倒す
- 2010/05/31 09:33:24 投稿
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高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090821.html#p01 今回の統合TVでは、DBCLSが提供するEMBOSS Explorerの解析ソフトの中から、sixpackについて紹介しています。sixpackを使うと、入力した塩基配列をアミノ酸配列に翻訳することができます。sixpackの場合、６つの読み枠を一度に表示することができます。最も終止コドンの出現が少ない翻訳パターンを探すことで正しいアミノ酸配列と塩基配列のコドン位置を推測できます。今回はサンプル配列としてヒトの脂肪代謝遺伝子peroxisome proliferator-activated receptor(PPAR) gammaの塩基配列をアミノ酸配列に翻訳する場合を例に説明しています。