この動画の修正版です。 http://www.nicovideo.jp/watch/sm29174350Giam でAVIを作り、ムービーメーカーで音声とクレジットを合成するところからやり直してみました。投稿するときに「音声が小さい」と表示が出ましたが、ノイズは解決したみたいです。
http://www.nicovideo.jp/watch/sm29252084