キーワード HTML が含まれる動画 ： 472337 件中 257 - 288 件目
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【統合TV】NCBI GEOの使い方２ 遺伝子プロファイルを検索する
高画質版はこちらです。http://togotv.dbcls.jp/20090213.html#p01NCBI GEOはNCBIが提供・維持管理している遺伝子発現情報のデータベースです。今回はGEOの使い方第２弾として興味のある遺伝子のプロファイルを検索する方法、およびその実験データの正規化されたファイルの取得方法を紹介しています。
【統合TV】遺伝子発現データの活用事例
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090217.html#p01 本日の統合TVは、2009年1月23日に東京工業大学にて開催された「統合データベース講習会：AJACS長津田」から、統合TVのプロデューサー 小野浩雅による「遺伝子発現データの活用事例」をお送りします
生命科学横断検索の利用法
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090219.html#p01本日の統合TVは、2009年1月23日に東京工業大学にて開催された「統合データベース講習会：AJACS長津田」から、統合データベースセンターの川本祥子 特任准教授による「生命科学横断検索の利用法」をお送りします。データベース検索の基本的な仕組みの説明に始まり、様々な検索エンジンの紹介 [想-IMAGINE Book Search、clustermed、iHOP、SAGOOL、SPYSEE]（13分～）、よりよい検索のための工夫（20分～）、文章の構造化について（24分～）、ソーシャルブックマーク（31分～）、横断検索（35分～）が紹介されています。
【統合TV】NCBI GEOの使い方4 データセットブラウザをさらに使い倒す
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090307.html#p01 NCBI GEOはNCBIが提供・維持管理している遺伝子発現情報(マイクロアレイ)のデータベースです。今回はGEOの使い方第4弾として、データセットブラウザ(Dataset browser)を利用して、一つの実験データセットを解析するツールの使い方をさらに詳しく紹介しています
【統合TV】ライフサイエンス辞書を使い倒す2009〜オンライン辞書編〜
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090227.html#p01 今回紹介するWebLSDオンライン辞書は、英和・和英検索が2009年1月1日に改訂され、英語9.3万語，日本語10.5万語に拡張されています。また共起検索およびシソーラスも充実しています。これらの辞書は、学術論文の計量的な解析を行って作成した独自のデータに基づいており，その解析材料としてはPubMedで公開されている膨大な文献抄録の他，協力を得られた出版社，学会などから提供されたテキスト情報を用いられているのが最大の特徴です。
【統合TV】PDBjを使ってタンパク質の立体構造を調べる
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090228.html#p01 今回紹介するxPSSS（XML-based Protein Structure Search Service）はXMLに基づいたタンパク質構造検索サービスです。xPSSSでは様々な条件で検索することができますが、最も単純な検索はPDB IDまたはキーワードによる検索で、PDBjのトップページから直接検索することができます。
【統合TV】ライフサイエンス辞書を使い倒す2009～その他のサービス編～
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090306.html#p01 ライフサイエンス辞書は、 京都大学大学院薬学研究科の金子周司先生が開発されている生命科学向けの辞書サービスです。今回紹介するサービスはオンデマンド英語教材とオンライン変換サービスの2つです。オンデマンド英語教材は生命科学(ライフサイエンス)関連の英文記事を、日本語の注釈つきで学習できるツールです。毎週記事の追加更新が行われています。大学院の入試など、生命科学系の英文をお探しの方にお勧めです。またオンライン変換サービスでは英文を入力するだけで、web上で専門用語の英和単語帳を作成したり、自作の英文のスペルチェックをすることも出来ます。
【統合TV】ライフサイエンス辞書をローカルに使い倒す2009
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090314.html#p01 ライフサイエンス辞書(WebLSD)は、 京都大学大学院薬学研究科の金子周司先生が開発されている生命科学向けの辞書サービスです。文章などを書いていて、生命科学分野の専門用語にからっきし弱いパソコンのかな漢字変換システムにイライラを覚えたことのある方は多いのではないのでしょうか？前回紹介したLSDプロジェクトで制作されている各種辞書はオンラインでの提供だけではなく、自分のパソコンにダウンロード・インストールして使える辞書も提供されています。今回は、Windows XP/Vista 用かな漢字変換辞書を自分のパソコンに導入して、快適な生命科学用語変換ライフを送る方法について紹介します。
データ共有が変える日本の生命科学
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090330.html#p01 2009年3月28日に日本農芸化学会2009年度大会（於：福岡国際会議場、マリンメッセ福岡）にて行われましたランチョンセミナー「データ共有が変える日本の生命科学」を三部作でお送りします。第一弾の今回は、川本祥子 ライフサイエンス統合データベースセンター 特任准教授による「データ共有が変える日本の生命科学」です。
今日から使える！情報検索 lifesciencedb.jp
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090331.html#p01 2009年3月28日に日本農芸化学会2009年度大会（於：福岡国際会議場、マリンメッセ福岡）にて行われましたランチョンセミナー「データ共有が変える日本の生命科学」から、河野信 ライフサイエンス統合データベースセンター 特任研究員による「今日から使える！情報検索 lifesciencedb.jp」です。
【統合TV】GOLD -Genomes Online Databaseを使い倒す 2009
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090403.html#p01 GOLDデータベースはゲノム塩基配列解読プロジェクトを集めたデータベースです。既に解読が終了したゲノムプロジェクトや、現在進行中のゲノムプロジェクトについて調べることができます。塩基配列や、発表された論文、解析を実施している機関などへのリンクがあります。
【統合TV】ArrayExpressを使い倒す 1
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090408.html#p01 ArrayExpressはEuropean Bioinformatics Institute (EBI)が提供・維持管理している遺伝子発現情報のデータベースです。今回は、まずArrayExpressの検索インターフェースを使って、自分の興味のあるマイクロアレイ実験データセットにたどり着く方法およびその生データのダウンロード方法について説明しています。
【統合TV】Reactomeを使い倒す〜1・基本編〜
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090424.html#p01 Reactomeは、ヒトの生体中での反応やパスウェイを整備したデータベースです。ここに収録されている情報は、それぞれの分野の専門家が編集しているため、非常に信頼性の高いデータベースです。代謝パスウェイだけでなく、シグナル伝達や膜輸送、感染など様々なパスウェイが扱われています。DNAマイクロアレイやプロテオーム解析、メタボローム解析の結果を解釈する際に利用できます。今回は、Reactomeの基本的な使い方を紹介しています。
【統合TV】ArrayExpressを使い倒す 2
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090417.html#p01 今回は、Atlas of Gene Expressionを使って、様々な実験条件における興味のある遺伝子の発現状況の高低を、グラフや色の濃淡で表示することにより、分かりやすく閲覧できる方法を紹介しています。例として、筋分化決定因子である"myogenic differentiation 1(myod)"の遺伝子発現状況を検索しました。
Human Protein Atlasを使い倒す 2009
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090501.html#p01 Human Protein Atlas(ヒューマンプロテインアトラスと読みます)は、スウェーデンの研究グループが提供しているヒトのタンパク質発現情報データベースです。さまざまなヒトの組織やガン細胞、細胞株におけるタンパク質の発現情報および局在を、特異的抗体を用いて得られた免疫組織化学染色写真をもとに調べることができます。2009年5月1日現在では6,103個の抗体および5,683,196枚の染色写真が閲覧可能です。また、蛍光抗体法による染色写真も充実しています。
Reactomeを使い倒す～2・Reactomeへのマッピング～
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090508.html#p01 Reactomeは、ヒトの生体中での反応やパスウェイを整備したデータベースです。ここに収録されている情報は、それぞれの分野の専門家が編集しているため、非常に信頼性の高いデータベースです。代謝パスウェイだけでなく、シグナル伝達や膜輸送、感染など様々なパスウェイが扱われています。DNAマイクロアレイやプロテオーム解析、メタボローム解析の結果を解釈する際に利用できます。今回は、発現データなどの網羅的なデータから関連するパスウェイを抽出するSkyPainterというツールを紹介します。
ATTED-IIを使い倒す
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090522.html#p01 ATTED-IIは、シロイヌナズナの遺伝子発現データを用いて、その機能や共発現遺伝子などを調べることができるデータベースです。今回の統合TVでは、ATTED-IIの検索機能の一つであるGene Tableを使って興味のある遺伝子の、機能や細胞内局在予測部位を調べる方法を紹介しています
生命科学系データベースカタログを使い倒す 2009
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090523.html#p01 生命科学系データベースカタログは、 ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)が提供する「データベースのデータベース」です。データベースが数多く存在する昨今、データベースをうまく使いこなすことが研究の進展を左右するといっても過言ではありません。しかし実際の利用者からは「必要なデータベースが見つからない」「何のデータベースがあるのか分からない」という声をよく聞きます。生命科学系データベースカタログでは、国内外のデータベースを目的や対象、生物種、提供機関別に分類し、それらの説明が日本語で書かれているのが特徴です。また個々のデータベースについて利用者がコメントをつけることもできます。
統合ホームページへようこそ 2009
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090530.html#p01 統合ホームページは文部科学省「統合データベースプロジェクト」のポータルサイトです。今回の番組では、統合ホームページを使いこなす上で知っておくと便利な特徴や小技などを初めての人でも分かるように紹介しています。
生命科学 学協会 カタログを使い倒す
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090612.html#p01 DBCLSが統合ホームページで提供するサービスの一つとして生命科学 学協会 カタログがあります。ここでは、生命科学に関連した様々な学協会を検索し、簡単にそのカタログやホームページを閲覧することが出来ます。
GenePaintを使ってマウスの胚や脳における遺伝子発現の局在を調べる
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090613.html#p01 GenePaintは、ドイツのマックス・プランク研究所が公開しているマウスの発生過程における遺伝子発現の局在をin situ hybridization（ISH）により調べた組織切片画像のデータベースです。登録されている切片画像はズームイン可能で、遺伝子によっては各部位における発現状況がランク付けされています。また、ある部位で特に強く発現している遺伝子や特徴的なパターンで発現している遺伝子のなどの条件で検索結果の絞込みを行うことも可能です。
BLATをプライマー設計支援ツールとして使い倒す2009
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090619.html#p01 BLAT（The BLAST-like Alignment Tool)は米国カリフォルニア大学サンタクルーズ校(UCSC)にて開発された高速なアラインメントツールで、主に質問配列がゲノム配列中のどの部分にヒットするか（ゲノムランディング(genome landing)といいます）探索するのに用いられています。ここではヒトの脂肪代謝遺伝子peroxisome proliferator-activated receptor (PPAR) gammaの塩基配列をサンプル配列として、BLATをプライマー設計支援ツールとして使い倒す方法を紹介します。ちなみに今回紹介するのに使っているURL http://genome.brc.mcw.edu/cgi-bin/hgBlat はUCSC Genome Browserのミラーサイトの一つで Medical College of Wisconsin, Milwaukee, WIのURLで、本家は http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgBlat になります。
PyMOLを使ってタンパク質の構造を見る
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090617.html#p01 PyMOLは、Pythonで書かれたオープンソースの分子ビューアです。Ver.1.0以降コンパイル済みのバイナリは有料化されていますが、自分でソースコードからコンパイルするか、教職員もしくは学生として登録すれば無料で利用できます。今回は、PyMOLの使い方(基本編)とMacへのインストール方法を解説しています。応用編のTVはこちらです。例として用いている3B7Eは、1918年に流行したスペイン風邪の原因となったH1N1型インフルエンザウイルスの増殖を助ける、ノイラミニダーゼ（NA: Neuraminidase) というタンパク質です。
Entrezを使って配列を検索する ~ヒトのheat shock factorのアミノ酸配列を得る~
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090624.html#p01 Entrezは、NCBIで提供されているさまざまなデータベースを横断的に検索するための検索エンジンです。ここでは、ヒトのheat shock factorのアミノ酸配列を取得する方法を通じて、Entrezの使い方の一例を示します。
PubMedの検索結果を定点観測する その2
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090627.html#p01 PubMed（「パブメド」と発音します）は、米国のNCBIから提供されている生物医学文献データベースです。2009年6月20日放送の「PubMedの検索結果を定点観測する その1」の続編として、webブラウザ Firefoxを使った場合のRSSフィードの取得・購読の仕方について説明しています。
Entrez SNP を使い倒す（後編）下戸遺伝子の多型をさぐる
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090630.html#p01 今回は下戸遺伝子(Asian Blush)として知られるALDH2の点突然変異を例に、Entrez SNP(dbSNP)の使い方をご紹介します。
Allen Brain Atlasを使い倒す ～基本編～
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090718.html#p01 The Allen Mouse Brain Atlasとは米国シアトルのAllen脳科学研究所が提供する、マウス脳を網羅する21000個以上の遺伝子発現を詳細に示した三次元マップを構築するためのデータベースです。マウス脳を数十万個の切片にし、in situ hybridizationを行い、すべての遺伝子の発現パターンを細胞レベルまで示しています。
Allen Brain Atlasを使い倒す～応用編～
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090719.html#p01 The Allen Mouse Brain Atlasとは米国シアトルのAllen脳科学研究所が提供する、マウス脳を網羅する21000個以上の遺伝子発現を詳細に示した三次元マップを構築するためのデータベースです。マウス脳を数十万個の切片にし、in situ hybridizationを行い、すべての遺伝子の発現パターンを細胞レベルまで示しています。今回は三次元マップを構築する方法と、一度に複数のデータを見る方法を紹介します。
鎌状赤血球症を引き起こす変異ヒトヘモグロビンをJmolで確認する
高画質版はこちら http://togotv.dbcls.jp/20090721.html#p01 鎌状赤血球症（Sickle-cell disease）は、赤血球の形状が鎌状になって酸素運搬機能が低下することにより発生する、遺伝性の貧血症です。以前の統合TV 「HapMapを使い倒す 鎌状赤血球のSNPをさぐる」では、HapMapの使い方を解説する例として、鎌状赤血球症を引き起こすSNP(Single Nucleotide Polymorphism)の位置を特定しました。今回は、SNPによるアミノ酸の違いを確認します。PDBに登録された正常型、変異型双方のタンパク質構造を比較し、変異したアミノ酸をJmolを用いて実際に確認します。
絵本"MOTHER"宣伝
CD付きの絵本、MOTHERが完成しました。機械と人間が暮らす世界は、どこか温かく少し切ないのです。http://motherxyou.web.fc2.com/index.html#
【RACE07】ニコ生シリーズ戦7 R1：ブラジル【GTREvo】
Porsche Carrera Cup Scandinavia ニコ生シリーズ戦7 5月27日開催分リプレイ(2倍速)
クリチバ
マルチ未経験者歓迎、スポット参戦有り、途中参加有り
鯖オープン21時頃～
P:45分(45分間練習)
Q:15分
W:5分～
R:10分ｘ2h（10分レースを2回）
※スタート方式：RACE1 ローリング RACE2 スタンディング
詳細は↓コミュでご覧下さい。
RACE07シリーズ戦マルチ.コミュ co84790
第1回 WTCC mylist/15950371
第2回 F3000 mylist/16143805
第3回 MX-5 mylist/16906827
第4回 MINI mylist/17445789
第5回 Lotus mylist/17928829
第6回 CATERHAM mylist/18694416
第7回 Porsche mylist/19211403
各リザルト→ http://nicorta.web.fc2.com/result.html
次回 sm10926137
【BMS】Moon phase Encounter (月面旅行)
ねこみま先生のBMS差分第一弾です mylist/16633866
僕の差分を奈那樹さんのサイトにて公開していただく事になりました！
ttp://flowermaster.web.fc2.com/index.html
他にも素晴らしい譜面があるので是非遊んでみてください